Nuestro organismo, tiene diferentes mecanismos mediante los cuales se defiende de agentes infecciosos como virus, bacterias, hongos y parásitos y de otro tipo de agentes que pueden ser tóxicos o que simplemente despiertan una reacción inmunológica porque son detectados como un patógeno (alergias). Mediante exámenes que permiten detectar y medir tanto los patógenos como la respuesta inmune, el laboratorio clínico aporta información muy importante para el diagnóstico, tratamiento y control de las distintas enfermedades ocasionadas por estos agentes.
Ejemplo: Antígeno del Rotavirus, anticuerpos contra el virus del Herpes, Anticuerpos IgE específico contra la leche, el camarón, el polvo.